想要开启那些隐藏在岛屿各处的密室大门，首先需要明白一个核心前提：完成游戏的一周目是解锁大多数深层秘密的基础。许多关键的密室与收集要素，例如工厂里的神秘铁箱、神庙二楼的隐藏门以及需要集齐的六个三角块，都只会在二周目，也就是重新开始新游戏后出现。游戏会明确提示你，只有进行二周目才能看到真相，因此直接选择新游戏并确认擦除记录，是踏上真正探险的第一步。
进入二周目后，开启密室大门往往依赖于收集特定的关键道具。其中最核心的一套道具是六个刻有符文的三角块，它们散落在岛屿各处，从初始的桥面到工厂内部、章鱼怪附近都能找到。收集齐这些三角块后，你需要前往神庙二楼那扇新出现的、带有六个凹槽的石门，按照之前在一楼房间墙上纸条获得的图案顺序，将三角块正确嵌入，才能打开这扇通往新区域的门。
除了依靠实体道具，一些密室大门的开启条件则与破解密码谜题直接相关。灯塔二楼的一个红色箱子需要输入特定密码才能打开，而这个密码的线索藏在古老的漂流瓶和神庙密室的投影中。你需要先在海边找到漂流瓶获取初始密码，在神庙密室触发投影获得关键提示，最终推导出箱子的正确密码，从而获得重要物品。神庙的第一道大门本身就是一个谜题，其开启密码直接绘制在从码头得到的漂流瓶内壁上，仔细观察并记录下瓶中的古老符号是开门的关键。
游戏中的部分大门开启条件与场景互动和时空变化紧密相连。在工厂区域修好损坏的电路是激活某些设备或开启通道的前提。而游戏最具特色的时间旅行机制也与此相关，在过去时空种下的种子，会在现在长成参天大树，成为你进入高空飞船的阶梯，这本身就是开启一扇通往新场景的大门。火箭飞船的大门则要求你根据之前探索中发现的壁画线索，正确放置花、骨头和海星这三样象征性的物品作为燃料。
