在忘仙中获取灵兽内丹最直接的途径就是商城系统，这里提供了多种付费选择。玩家可以在商城里通过直购限时礼包快速获得内丹，例如特定的圣宠礼包就包含此项资源。每逢圣宠曜日之类的活动期间，商城还会推出内丹折扣，像第二颗灵兽内丹享受五折优惠就很有吸引力。对于VIP玩家而言，月度礼包是稳定获取白色品质灵兽内丹等道具的可靠来源，而游戏内不定时推出的节日回馈礼包也常常将内丹作为奖励内容之一，为玩家提供了补充资源的窗口。
除了直接购买，通过游戏内特定玩法积累资源进行兑换也是一个重要方法。玩家需要参与各类活动来收集妖尾精华之类的特殊道具，当数量达到要求后便可前往指定地点如缥缈王城的皇宫进行兑换，以此获得九尾妖狐及与其关联的灵兽内丹。开启圣宠宝箱同样有概率直接开出内丹，这为获取增添了一份随机性的惊喜。更为巧妙的是，游戏内置了合成系统，允许玩家将四枚相同品质的紫色或橘红色内丹合成为一枚更高阶的内丹，这一机制是宠物突破星级限制、实现战力飞跃的关键环节。
对于倾向于免费获取的玩家，副本与日常玩法构成了核心渠道。大雁塔副本在通关后有概率掉落各种品阶的内丹，甚至有机会产出高级内丹，是挑战与收益并存的好去处。在宝宝岛等地图携带灵兽与精英怪战斗，能够提升内丹的掉落概率，让刷怪过程更有目标。游戏内的结丹系统则提供了另一种思路，玩家可以消耗鼎炉与丹元材料自行炼制内丹，其中使用高级丹元材料必出高级内丹，让产出更具确定性。完成日常活跃度目标或限时任务，也有机会将内丹资源纳入奖励清单。
玩家之间的交易以及系统自带的炼化功能，为内丹获取提供了灵活且有效的补充渠道。已经获得的高级内丹可以在游戏的摆摊系统中进行交易流通，不过需用于交易的内丹需要将累计的经验清零，但其突破重数会得以保留。炼化功能则允许玩家消耗三枚同级内丹来合成一枚新的同等级内丹，如果混合投入高级和低级内丹，那么合成结果的内丹类型将是随机的，这为资源整合与转换提供了可能。参与竞技场积累货币兑换，或者完成师徒系统指定的任务获取奖励，也可能成为间接获得内丹的途径之一。
